"Y no me sentiré mal por eso ... porque voy a sobrevivir. Está en mi imperativo biológico. Es todo lo que sé hacer "- Eugene Porter, Time For After |
Cuando la alianza de comunidades se presentó en los portones del Santuario para dar inicio a una gran guerra sin cuartel, Eugene permaneció al lado de Negan como uno de sus generales de confianza y trató de razonar con sus antiguos compañeros, pero Rick lo hizo callar. Al estallar la batalla, Eugene escapó del fuego cruzado y se refugió dentro del edificio."Mercy"
Luego de que los Salvadores, a excepción de Negan, quedaran atrapados en el Santuario debido a la horda de caminantes que el grupo de Rick liberó en el patio, Eugene fue el primero en percatarse de las fallas del plan que estaban ideando para deshacerse de las criaturas y también fue visto por todos como el principal sospechoso de ser el delator que los estaba traicionando. Gracias a una conversación que tuvo con Dwight, Eugene logró deducir que en realidad era él el traidor al que estaban buscando, pero prefirió guardarse la información para sí mismo, incluso cuando Negan regresó al edificio y le prometió una buena recompensa si lograba descubrir quién era la persona."The Big Scary U"
No pasó mucho tiempo para que Eugene pusiera al tanto a Dwight respecto a saber la verdad sobre él, advirtiéndole que desista de su plan de continuar ayudando a Rick. Así también, visitó al Padre Gabriel, a quien tenían prisionero en la enfermería y con una grave infección, el cual intentó convencerlo de ayudarlo a liberar al doctor Carson para que pudiera ir a atender a Maggie, pero sin éxito. Eventualmente Eugene ideó una manera de deshacerse de los caminantes que bloqueaban las salidas, valiéndose para ello de un dron con sistema de audio que fabricó, sin embargo, Dwight impidió que continuara adelante con su idea y destruyó la maquina a tiros. Luego de que la horda ingresara al edificio tras un segundo ataque de Daryl y sus amigos, Eugene lamentó bastante la pérdida de vidas inocentes dentro del Santuario y estuvo a punto de contarle todo lo que sabía a Negan pero al final no pudo hacerlo."Time For After"
Gracias a un plan ideado por Eugene, los Salvadores lograron eliminar a los caminantes que habían ingresado al Santuario y fueron en busca de Rick y sus amigos para castigarlos. Mientras Negan y los otros se encontraban afuera, Eugene, aquejado por la culpa, decidió finalmente ayudar a Gabriel y al doctor Carson a escapar y les proveyó de todo lo necesario."How It's Gotta Be"
Cuando Negan regresó al Santuario, si bien cuestionó a Eugene sobre al escape de los prisioneros, no le prestó mayor importancia ya que estaba convencido de que lograrían atraparlos nuevamente. Más bien, buscó a Eugene para ponerlo a cargo de su propio puesto de avanzada en la fábrica de balas y le encargó crear municiones para los Salvadores. Abrumado por todo lo que estaba viviendo, Eugene comenzó a comportarse de forma déspota con la gente a su cargo, incluso con Gabriel, quien fue llevado a trabajar para él tras haber sido recapturado."Dead Or Alive Or"
Fiel a la tarea que le encomendaron, Eugene coordinó la recepción de cientos de casquillos de bala para poder seguir fabricando proyectiles, sin saber que a lo lejos era observado por Daryl y Rosita, quienes fueron hasta la fábrica para eliminarlo ya que era la única forma de frenar lo que estaba haciendo."Still Gotta Mean Something"
Eugene fue emboscado afuera de la fábrica por Daryl y Rosita, quienes en lugar de matarlo se lo llevaron para obligarlo a trabajar para ellos. Eugene defendió su lealtad hacia Negan diciendo que sólo estaba tratando de sobrevivir y afirmó que Rick era el verdadero culpable de todas las muertes que se produjeron a causa de la guerra, provocando en consecuencia que Rosita lo insulte por ser un cobarde y un traidor. Eventualmente Eugene consiguió escapar de sus captores vomitándole encima a Rosita para distraerla y luego se escondió en un montículo de cenizas para perderles el rastro. Tras volver a la fábrica, Eugene les dio instrucciones a sus empleados de terminar lo más pronto posible las balas, ya que estaba dispuesto a eliminar a todos sus enemigos."Worth"
Con su trabajo terminado, Eugene regresó al Santuario para enseñarle a Negan lo que había producido y se enteró que Dwight había sido expuesto como el traidor. Eugene, entonces, le sugirió a Negan formar una sola línea de disparo para abrumar y eliminar a la alianza de comunidades de una sola vez, idea que fue bien recibida y puesta en marcha de inmediato. En el campo de batalla, Eugene estuvo en la primera fila junto a Negan mientras trataban de negociar la rendición de Rick y cuando finalmente los Salvadores abrieron fuego, todas las armas les explotaron en la cara pues Eugene las había saboteado. Con furia, Negan fue tras Eugene por lo que había hecho, pero Gabriel y Dwight lo socorrieron, al igual que Rosita, quien lo salvó justo a tiempo de ser asesinado por otros Salvadores. Gracias a Eugene, el grupo obtuvo la victoria y culminada la pelea, él se reunió con sus amigos para escuchar el discurso de Rick."Wrath (The Walking Dead)"